TIP - MİKROBİYOLOJİ ANABİLİM DALI
Akademik Kadro
Genel Bilgiler
Araştırma Alan ve Olanakları
Lisansüstü Eğitim Programları
Doktora Dersleri
AKADEMİK KADRO
PROFESÖRLER
TÖRE Okan (Chairperson): B.S., Ankara University; Ph.D., Gülhane Military Medical Academy.
GEDİKOĞLU Suna: B.S. and Ph.D., Hacettepe University.
HELVACI Safiye: B.S., İstanbul University; Ph. D., Uludağ University.
ENER Beyza: B.S., Ankara University; Ph. D., Marmara University.
MISTIK Reşit: B.S., İstanbul University; Ph. D., Uludağ University.
DOÇENTLER
AKALIN Halis: B.S., İstanbul University; Ph.D., Uludağ University.
ÖZAKIN Cüneyt: B.S., Ankara University; Ph.D., Uludağ University.
YARDIMCI DOÇENTLER
SıINIRTAŞ Melda: B.S. Ege University; Ph.D., Uludağ Üniversity
BAŞA DÖN
GENEL BİLGİLER Mikrobiyoloji Anabilim Dalı lisansüstü eğitim çerçevesinde Mikrobiyoloji doktora eğitimi verir. Mikrobiyoloji Anabilim Dalı'nda doktora eğitimini bitiren öğrenciler Mikrobiyoloji Doktoru (Ph.D.) unvanını alırlar. Doktora eğitimi sırasında temel mikrobiyolojik bilgileri edinmelerinin yanı sıra, öğrencilerin mikrobiyolojideki güncel gelişmeleri izlemeleri, literatür takip etmeleri, ilgi alanlarında bilimsel projeler planlamaları ve anabilim dalında yapılan araştırmalara katılmaları gereklidir. Doktora öğrencileri her dönemde birer makale ve seminer sunarak, yayın tarama, seminer hazırlama ve sunma teknikleri konularında da kendilerini geliştirirler.
Mikrobiyoloji bilimindeki hızlı gelişim sürecine koşut olarak, bilgiye hızlı ulaşmak da oldukça önem kazanmıştır ve doktora eğitimi süresince öğrenciler en doğru bilgiye en hızlı nasıl ulaşabileceklerini öğrenirler ve pratik olarak da uygularlar. Araştırmacı kişiliklerinin ve el becerilerinin gelişmesi için deneysel çalışmalarda sorumluluk almalarına özen gösterilir. Diğer anabilim dallarından dersler aldırılarak bilimsel ufuklarının genişletilmesi ve konulara çok yönlü bakabilme yetisi kazanmaları amaçlanır.
Mikrobiyoloji doktora eğitimini bitirmiş bir öğrencinin bilgi, beceri ve bilimsel anlayış bakımından üstün özellikleri kazanmış olması beklenir.
BAŞA DÖN ARAŞTIRMA ALANLARI VE OLANAKLARI
Mikrobiyoloji Anabilim Dalı'nda yapılan bilimsel çalışmalar birkaç ana konu üzerinde yoğunlaşmıştır.
1) Bakteriyoloji Laboratuvarı : Bu laboratuvarda, bakterilerle ilgili rutin ve deneysel çalışmalar yürütülmektedir. Laboratuvarda bulunan başlıca malzemeler; çeşitli mikroskoplar, santrifüjler, su banyosu, otomatik pipet, etüv ticari identifikasyon sistemleri, otoklavlar, Pasteur fırını, distile su cihazı ve biyolojik kabinlerdir.
2) Parazitoloji Laboratuvarı: Biyomedikal bir disiplin olarak parazitoloji, geleneksel olarak protozoa, helmint ve artropodlar ile ilgilenir. Safra ve barsak parazitleriyle doku ve kan parazitlerinin tanısı bu laboratuarda gerçekleştirilir. Birçok barsak ve kan parazitleri hayat sikluslarındaki değişik evrelere ait morfolojileri ile tanınırlar ve dolayısıyla morfolojileri hakkında deneyim kazanılması öğrencilerden beklenmektedir. Ölçülü oküleri olan mikroskoplar, santrifüjler, ve otoklav bu laboratuarda bulunan esas cıhazlardır.
3) Mikoloji Laboratuvarı : Bu laboratuvar tıbbi önemi olan mantarları izole ve identifiye etme amacıyla kullanılmaktadır. Parazitler gibi mantar identifikasyonunda parazitler çok önemlidir. Dolayısıyla deneyim kazanılmalıdır. Laboratuarda yeterli kültür koleksiyonu ve standart suşlar vardır. Çeşitli virülans çalışmaları ve antifungal duyarlılık testleri devam etmektedir ve öğrenciler bu araştırmalara koopere olabilir. Bir pH metre, iki inkübatör, mikroskoplar, biyolojik kabin, santrifüj ve spektrofotometre bu laboratuarda bulunan cihazlardır.
4) Viroloji Laboratuvarı : Viral hastalıkların çoğunda laboratuar tanı genellikle zor ve gereksizdir fakat, bilimsel açıdan yapılmalıdır. Bu laboratuarda bazı hücre kültür line'ları ve bunları devam ettirecek yeterli ekipman bulunmaktadır. Biyolojik kabinler, nitrojen tankı, derin dondurucular (-80), CO 2 etüvü mevcuttur. Ayrıca serolojik, immunolojik ve moleküler teknikler de kullanılabilir. Bir flüoresan mikroskobu, ELISA cihazı, termosaykler, ve elektroforez cihazı vardır.
5) Seroloji Laboratuarı: Bütün serolojik testler bu laboratuarda öğrenilir. Jel difüzyon, aglütinasyon, komplemen fiksasyon, nötrolizasyon testleri yapılmaktadır. Otamatik pipetler, su banyoları, inkübatörler bu laboratuarda bulunan cihazlardır.
6) Moleküler Araştırma Laboratuvarı: Bakteri tipleme ve epidemiyolojik çalışmalar bu laboratuarda yapılmaktadır. Hastanedeki epdemiyolojik çalışmlar bakterilerin direnç patternleri çalışılmaktadır. Pulse field jel elektroforez, hibridizasyon testleri, nükleik asit aplifikasyonu yapılmaktadır.
BAŞA DÖN
MİKROBİYOLOJİ ANABİLİM DALI LİSANSÜSTÜ EĞİTİM PROGRAMLARI
Mikrobiyoloji Doktorası (Ph.D.)
BAŞA DÖN
DOKTORA DERSLERİ
Doktora Zorunlu Dersleri
TMK DZ 01 Bakterilerin yapısal özellikleri (2-0)2
TMK DZ 02 Diğer mikroorganizmaların yapısal özellikleri (1-0)1
TMK DZ 03 Mikroorganizmaların izolasyon ve identifikasyonu (0-4)2
TMK DZ 04 Medikal önemi olan bakteriler (2-0)2
TMK DZ 05 Medikal önemi olan viruslar (2-0)2
TMK DZ 06 Medikal önemi olan parazitler (1-0)1
TMK DZ 07 Medikal önemi olan mantarlar (1-0)1
TMK DZ 08 Doktora Uzmanlık Alan Dersi
Doktora Seçimli Dersleri
TMK DS 01 Mikrobiyoloji Laboratuarında kullanılan otomasyon teknikleri (1-4)3
TMK DS 02 Mikrobiyolojik moleküler tanı teknikleri (1-2)2
TMK DS 03 Hastane enfeksiyonları (1-0)1
TMK DS 04 Toksi-enfeksiyöz hastalıklar (1-0)1
TMK DS 05 Cinsel yolla bulaşan hastalıklar (1-0)1
TMK DS 06. Besin Mikrobiyolojisi (1-0)1
TMK DS 07. Antimikrobiyal etki ve direnç mekanizmaları (2-0)2
TMK DS 08. Bakteriyal enfeksiyonların patogenezi (2-0)2
TMK DS 09. Mikrobiyolojide sterilizasyon dezenfeksiyon (1-0)1
TMK DS 10. Hücre Kültürü Uygulamaları (1-2)2
DOKTORA DERSLERİNİN TANIMLANMASI
TMK DZ 01 Bakterilerin yapısal özellikleri (2-0)2
Bakterilerin taksonomi ve sınıflandırılması, bakteri morfolojisi (koloni ve mikroskobik morfoloji), bakteri boyama teknikleri, bakteri kültür ve identifikasyon teknikleri, bakteri metabolizması, bakteri genetiği bu dersin ana noktalarıdır. Teorik bilgiler laboratuarda pratik ile desteklenir.
TMK DZ 02 Diğer mikroorganizmaların yapısal özellikleri (1-0)1
Bu derste bakteri dışındaki mikroorganizmalar tartışılır. Parazit, mantar ve viruslar diğer mikroorganizmalardır ve bunların fonksiyonel özellikleri öğretilir. Taksonomi, klasifikasyon, morfolojik kriterler, kültür ve boyanma özellikleri yine önemli başlıklardır. Teorik bilgiler laboratuarda pratik ile desteklenir.
TMK DZ 03 Mikroorganizmaların izolasyon ve identifikasyonu (0-4)2
Tamamen pratik bir derstir. Haftada 4 saat pratik mikrobiyolojik yöntemler hakkında deneyim kazanılmasına yardım eder. Klinik ve doğal örneklerin sıvı ve katı besiyerlerine ekilme teknikleri, sıvı ve katı besiyerlerinde üremelerin yorumlanması, saf kültür teknikleri, kolonilerin boyanması, biyotipleme, serotipleme ve zaman zaman genotipleme öğretilecek konulardır.
TMK DZ 04 Tıbbi önemi olan bakteriler (2-0)2
İnsanlarda hastalık oluşturan bakteriler tartışılacaktır. Özellikler insanlara virülans ve patolojik etkileri, oluşturdukları klinik semptomlar, bulundukları klinik örnekler ve mikrobiyolojik özellikleri ana konulardır.
TMK DZ 05 Tıbbi önemi olan virüsler (2-0)2
Bu ders virüs hastalıklarını hücresel seviyede (sitopatogenez), konak seviyesinde (hastalık mekanizması) ve popülasyon seviyesinde (epidemiyoloji ve kontrol) tartışma üzerine odaklanmıştır. Antiviral immun yanıt da tartışılır.
TMK DZ 06 Tıbbi önemi olan parazitler (1-0)1
Parazitolojinin temel noktaları, insanları etkileyen tüm parazitlerin hayat siklusları ve paraziter hastalıklarda insidans ve prevelansı düşürmek için gerekli koruma önlemleri bu dersin ana konularıdır.
TMK DZ 07 Tıbbi önemi olan mantarlar (1-0)1
Mantarlar doğada serbest saprofit olarak çok yaygın yaşarlar. Bitkiler için önemli patojenler olup sıklıkla gıdaların bozulmasına sebep olurlar. Genellikle insan vücudunda geçici çevresel kolonizan olarak bulunurlar ancak, bu ilişkiden hiçbir yara sağlamazlar. Bu nedenle bir enfeksiyondaki rollerinin belirlenmesi güçtür ve bu ders özellikle insanlar için patojen olan mantarlar üzerine odaklanacaktır.
TMK DS 01 Mikrobiyolojide kullanılan otomasyon teknikleri (1-4)3
Bu ders daha çok patojen mikroorganizmalar ve onların tanımlanmasında kullanılan yeni teknikler ile ilgilenmektedir. Konvansiyonel metotlar halen geçerli ve kullanılıyor olsa da, daha bir çok metot bulunmaktadır. Bu metotlar sadece zaman kazandırmayıp laboratuar tarafından verilen sonuçların güvenilirliğini arttırmaktadır.
TMK DS 02 Mikrobiyolojik moleküler tanı yöntemleri (1-2)2
Bu ders hibridizasyon ve nükleik asit aplifikasyon prensiplerini anlattığı gibi, patojenlerin tanımlanması ve karekterizasyonunda da kullanılmaktadır. Bu teknikler epidemiyolojik ve nazokomal sürvelens çalışmalarında geniş yer bulmaktadır.
TMK DS 03 Hastane enfeksiyonları (1-0)1
Hastanede gelişen enfeksiyonlara hastane enfeksiyonu denir. Hastane enfeksiyonlarının epidemiyolojisinin toplumdan kazanılmış enfeksiyonlardan tamamen farklı olması böyle bir dersin konulmasının nedenidir. Hastane enfeksiyonları ilerlemiş tıpta önemli bir sağlık problemidir. Bu ders hastane enfeksiyonlarına neden olan faktörleri, bu enfeksiyonlardan korunma ve kontrolü işler.
TMK DS 04 Toksi-enfeksiyöz hastalıklar (1-0)1
Mikroorganizmaların kendileri tarafından değil, toksinleri özellikle ekzotoksinleri tarafından oluşan hastalıkları işler. Bu hastalıkların mekanizması bu hastalıklara tanıdaki yaklaşım tartışılır.
TMK DS 05 Cinsel yolla bulaşan hastalıklar (1-0)1
Cinsel yolla bulaşan hastalıklar insen sağlığının en önemli problemlerinden biridir. Etyolojik ajanlar, geçiş yolları, bu hastalıkların kontrolü ve bu hastalıklardan korunma bu dersin ana noktalarıdır.
TMK DS 06 Besin Mikrobiyolojisi (1-0)1
Besinler gastrointestinal yolla bulaşta en sık sorumlu olan aracılardır. Besin mikrobiyolojisinde, gıda maddelerinde sıklıkla bulunabilecek bakteriler incelenir. Gıdaların saklama koşulları ve soğuk zinciri kıran etkenler bu dersin ana konularıdır
TMK DS 07 Antimikrobiyal etki ve direnç mekanizmaları.(2-0)2
Antimikrobik tedavi günümüzde en sık kullanılan tedavi şeklidir. Ancak antimikrobiklere karşı mikroorganizmaların geliştirdiği direnç tedavide her zaman sorun oluşturmakta ve istenmeyen sonuçlara yol açmaktadır. Bu derste direnç mekanizmaları ve dirençten korunma yollarına odaklanılır.
TMK DS 08 Bakteriyal enfeksiyonların patogenezi (2-0)1
Bu derste çeşitli bakteriyal enfeksiyonlarındaki konak savunma sistemleri ve mikrobiyal virülans faktörlerine değinilir. Bu iki noktanın dengede kalması enfeksiyonların kontrolü açısından çok önemlidir
TMK DS 09 Mikrobiyolojide sterilizasyon dezenfeksiyon (1-0)1
Sterilizasyon ve dezenfeksiyon yollarının detaylı olarak aktarıldığı bir dersdir. Laboratuar koşullarında enfeksiyöz ajanları ile hem kişilere hem de çevreye zarar vermeden çalışılması çok önemlidir. Bu nedenle bu konulardaki ince ayrıtılar aktarılmaya çalışılır
TMK DS 10 Hücre kültürü uygulamaları (1-2)2
Bilindiği gibi hücre kültürü virus ve zorunlu hücre içi bakterilerini üretmek için kullanılmaktadır. Ancak hücre kültürlerini idame ettirmek zor olup özel teknik ve bilgi gerektirir. Bu ders iki saat uygulaması ile bu özel teknikleri öğretmeyi hedefler.
BAŞA DÖN
|
