TIP BİYOKİMYA ANA BİLİM DALI

Akademik Kadro
Genel Bilgiler
Araştırma Alan ve Olanakları
Lisansüstü Eğitim Programları
Doktora Dersleri

AKADEMİK KADRO
PROFESÖRLER
TOKULLUGİL, H. Asuman: (Anabilim Dalı Başkanı): M.D. Hacettepe Üniversitesi. Uzmanlık Uludağ Üniv. Tıp Fak.
ÖZALP, Ülkü: B.S. Ankara Üniversitesi Fen Fakültesi Kimya Müh. M.S. Birmingham Tech. Univ. ( İngiltere) Ph.D. Birmingham Tech. Univ. ( İngiltere)
GÜR, Esma: M.D. İstanbul Üniv. İstanbul Tıp Fak. Uzmanlık İstanbul Üniv. İstanbul Tıp Fak.
DİRİCAN, Melahat: M.D. Uludağ Üniv. Tıp Fak. Uzmanlık Uludağ Üniv. Tıp Fak.

DOÇENTLER
ULUKAYA, Engin: M.D. İstanbul Üniv. Cerrahpaşa Tıp Fak. Uzmanlık Uludağ Üniv. Tıp Fak. Ph.D. School of Biochem and Mol. Biology, Leeds ( İngiltere)
ÖZARDA İLÇÖL, Yeşim: M.D. İstanbul Üniv. İstanbul Tıp Fak.,Uzmanlık Marmara Üniv. Tıp Fak.
SERDAR, Zehra: M.D İstanbul Üniv. Cerrahpaşa Tıp Fak. Uzmanlık Uludağ Üniv. Tıp Fak.
SARANDÖL, Emre: M.D. Uludağ Üniv. Tıp Fak. Uzmanlık Uludağ Üniv. Tıp Fak

YARDIMCI DOÇENTLER .

ÖĞRETİM ELEMANLARI

ÇOLAKOĞULLARI Mukaddes: M.D. Ege Üniv. Tıp Fak. Uzmanlık Uludağ Üniv. Tıp Fak
YILMAZTEPE ARZU: M.D. Hacettepe Ünv. Tıp Fak. Uzmanlık Uludağ Üniv. Tıp Fak.

GENEL BİLGİLER
       Biyokimya Anabilim Dalı lisansüstü eğitim çerçevesinde Biyokimya doktora eğitimi verir. Biyokimya Anabilim Dalı'nda doktora eğitimini bitiren öğrenciler Biyokimya Doktoru (Ph.D.) unvanını alırlar. Doktora eğitimi sırasında temel biyokimya bilgileri edinmelerinin yanısıra, öğrencilerin bu alandaki güncel gelişmeleri izlemeleri, literatür takip etmeleri, kendi ilgi alanlarında bilimsel projeler planlamaları ve anabilim dalında yapılan araştırmalara katılmaları gereklidir.
      Diğer anabilim dallarından dersler aldırılarak bilimsel ufuklarının genişletilmesi ve konulara çok yönlü bakabilme yetisi kazanmaları amaçlanır.
      Biyokimya Anabilim Dalı'nda eğitim görecek doktora öğrencilerini, çağımızın büyük araştırma projelerinden olan, oksidatif stres ve kanser/apoptozis konularında dünya standartlarında yarışabilecek hale getirebilmek ve bölümümüzde gerçekleştirilen projelerimizin sonuçlarının biyolojik bilimler sahasının en önemli dergisi olan Nature'da yayınlanmış olduğunu görmek ve sadece Türkiye'de değil tüm dünyada biyokimya doktorası yapmak isteyenlerin tercih edeceği bir merkez haline getirebilmek amaçlanır.

BAŞA DÖN

     Biyokimya Anabilim Dalı'nda yapılan bilimsel çalışmalar birkaç ana konu üzerinde yoğunlaşmıştır. Özellikle oksidatif stres ve kanser/apoptozis konularında güncel çalışmalar sürdürülmektedir. Biyokimya Anabilim Dalı'ndaki araştırma laboratuvarları ve olanakları aşağıda sunulmuştur.

1) Araştırma Laboratuvarı : Özelikle oksidatif stres ve antioksidan sistemler ile ilgili çalışmalar yürütülmektedir. Laboratuvarda bulunan başlıca cihazlar spektrofometre, HPLC cihazı, santrifüj, pHmetre, hassas terazi, ısıtıcı-manyetik karıştırıcı, su banyosu,vorteks, otomatik pipetler.

2) Apoptozis ve Kanser Araştırma Laboratuarı: Bu laboratuvarda apoptozis ve kanser araştırma ile ilgili çalışmalar yapılmaktadır. Tam donanımlı bir hücre kültür laboratuvarı ve beraberinde SDS-PAGE ve Western Blot çalışmaları yapmaya uygun elektroforez ünitesi bulunmaktadır. Ayrıca, immünositokimya ve immünohistokimya metodları çalışılabilmektedir. Laboratuvarda temel bilim araştırmalarının yanısıra klinikle ilişkili olarak tümör kemosensitivite testi (onkogram) çalışmaları yapılmaktadır.

3) Öğrenci Laboratuvarı: Öğrenci eğitimi ve uygulamaları için kullanılmaktadır.

BAŞA DÖN

Biyokimya Doktorası (P.h.D.)

DOKTORA DERSLERİ

Doktora Zorunlu Dersleri
TBK DZ 01   Proteinlerin Yapısı ve Fonksiyonları (2-2)3
TBK DZ 02   Enzimatik Reaksiyonlar ve Enzim Kinetiği (2-2)3
TBK DZ 03   Lipidler, Lipoproteinler, Apolipoproteinler, Lipoprotein Metabolizması Bozuklukları (2-2)3
TBK DZ 04   Karbonhidrat Metabolizması: Major ve Minör Metabolik Yollar (1-2)2
TBK DZ 05   Doktora Uzmanlık Alan Dersi

Doktora Seçimli Dersleri
TBK DS 01   Endokrin Sistem Biyokimyası (2-0)2
TBK DS 02   Programlanmış Hücre Ölümü (1-0)1
TBK DS 03   Oksidatif Stres ve Antioksidanlar (1-2)2
TBK DS 04   Genel Laboratuvar Teknikleri (0-2)1
TBK DS 05   Biyokimyada Kullanılan Temel Analiz Yöntemleri (0-2)1

DOKTORA DERSLERİNİN TANIMLANMASI

TBK DZ 01 Proteinlerin Yapısı ve Fonksiyonları (2-2)3
Amino asitlerinin yapısı, özellikleri, sınıflandırması ve reaksiyonları; Amino asitlerin endojen sentez ve yıkım yolları; Proteinlerin yapısı ve sınıflaması, protein tayin yöntemleri incelenecek. Amino asit ve proteinlerin reaksiyonları uygulamalı olarak gösterilecek. Bu ders ile öğrencilerin canlı organizmaların önemli makromolekülleri olan proteinlerin özellikleri, diğer makromoleküller ile ilişkileri ve organizmadaki fonksiyonlarını kavramaları sağlanacaktır.

TBK DZ 02 Enzimatik Reaksiyonlar ve Enzim Kinetiği (2-2)3
Canlı organizmaların sağlıklı fonksiyonu için enzimler önemli role sahiptir. Ayrıca, enzimler gerek tanı gerek takip için değerli klinik parametrelerdir. Enzimlerin yapılarının, etki mekanizmalarının ve bu mekanizmadaki prensiplerin anlaşılması organizmadaki enzimatik reaksiyonların değerlendirilmesinde çok önemlidir. Bu ders, enzim yapıları, enzimatik reaksiyonların işletişi, izoenzimler ve önemleri, enzim inhibisyonu konularını açıklayarak enzim tayin yöntemleri ve klinik tanı ve takipte önemli olan enzimleri incelemeyi amaçlamaktadır. Bu doğrultuda düzenlenen ders içeriği ile; 1. Enzimlerin yapılarının ve özelliklerinin öğretilmesi, 2. Enzimatik reaksiyonların işleyiş prensiplerinin öğretilmesi, 3. Kofaktör kavramının ve değişik kofaktörlerin etki yollarının öğretilmesi, 4. Enzim inhibisyonunun açıklanması, 5. Vücutta enzim aktivitesinin nasıl kontrol edildiğinin öğretilmesi, 6. İzoenzim kavramının açıklanması ve klinik uygulamadaki yerinin gösterilmesi, 7. Klinik tanıda enzimlerin yerinin açıklanması, 8. Enzim tayin yöntemlerinin öğretilmesi hedeflenmiştir.

TBK DZ 03 Lipidler, Lipoproteinler, Apolipoproteinler, Lipoprotein Metabolizması Bozuklukları (2-2)3
Lipitler vücudumuzun temel enerji kaynağı ve yapı taşıdır, fakat düzeylerinin yüksek olması aterosklerotik kalp-damar hastalıkları gibi dünyada en başta gelen ölüm nedenlerinden birisiyle sonuçlanmaktadır. Lipoproteinler, lipitlerin kanda taşınması ve metabolizmalarında baş rolü oynayan moleküllerdir. Bu dersin amacı lipoproteinlerin yapım, işlev ve yıkımlarını incelemek ve bunlarla ilgili bozuklukları öğrenmektir. Lipid profilinin incelenmesi ve aterosklerozla ilişkilendirilmesi de başlıca hedeflerden birisidir. Dersin hedefleri: Lipoproteinlerin yapılarının ve özelliklerinin öğretilmesi; lipoproteinlerin kaynaklandıkları dokular ve dolaşımda uğradıkları değişimlerin öğretilmesi; lipoproteinlerin işlevlerinin öğretilmesi; lipoprotein metabolizma bozukluklarının tanımının ve oluşum nedenlerinin anlatılması; serbest radikal, antioksidan ve oksidatif stres kavramlarının öğretilmesi; atherskleroz risk faktörlerinin biyokimyasal temellere dayandırılarak öğretilmesi; LDL oksidasyonunun anlatılması; paraoksonaz enziminin tanıtılması; obesite ve metabolik sendromun anlatılması.

TBK DZ 04 Karbonhidrat Metabolizması: Major ve Minör Metabolik Yollar (1-2)2
Karbonhidratların yapısı ve reaksiyonları, ilgili metabolik yollar ve düzenlenmesi

TBK DS 01 Endokrin Sistem Biyokimyası (2-0)2
Hormonların yapıları, sentezleri, sekresyonları, metabolizmaları, vücuttaki etkileri ile endokrinolojik testler ve klinikteki kullanımı.

TBK DS 02 Programlanmış Hücre Ölümü (1-0)1
Son yıllarda gittikçe önemli bir araştırma konusu olan ve tıpta birçok hastalığın oluşumunda rol aldığı düşünülen apoptozisin her yönüyle anlaşılmasının sağlanması ve öğrenilen bilgiler ışığında henüz araştırılmamış hastalıklarda apopotozisin olası yerinin tartışılabilmesini sağlamaktır. Öncelikle apoptozisin terminolojisinden bahsedilecek ve genel olarak apoptozisin doğru tanımlanması sağlanacaktır. Bunun için nekrozisden farkı anlatılacaktır. Sonra, oluşumunda rol alan mekanizmalar ve apoptozisin saptanabildiği metodlardan bahsedilecektir..

TBK DS 03 Oksidatif Stres ve Antioksidanlar (1-2)2
a. Serbest oksijen radikallerinin yapıları, fiziksel ve kimyasal özellikleri ile hücresel kaynakları ve biyolojik sistemlerde rol oynadıkları tepkimeleri incelemek ve klinik hastalıkların gelişimindeki rollerini araştırmak, b. Antioksidan savunma sistemlerini oluşturan enzimlerin (süperoksid dismutaz, glutatyon peroksidaz, glutatyon redüktaz, katalaz), makromoleküllerin (seruloplazmin, transferin, ferritin) ve mikromoleküllerin (E vitamini, C vitamini, A vitamini, ürik asit, bilirubin, östrojen) yapılarını ve antioksidan fonksiyonlarını araştırmaktır.

TBK DS 04 Genel Laboratuvar Teknikleri (0-2)1
Laboratuarda güvenli çalışma kuralları, çözelti hazırlama, konsantrasyon hesapları, dilüsyonlar, tartım-terazi kullanma, pHmetri vs gibi konulardaki eğitimi amaçlamaktadır.

TBK DS 05 Biyokimyada Kullanılan Temel Analiz Yöntemleri (0-2)1
Biyokimya laboratuarında halen kullanılmakta olan fotometrik, kromatografik, elektroforez, elektrokimyasal ve immunokimyasal yöntemlerin temel prensipleri hakkında yeterli bilgi sahibi olarak bu tekniklerin doğruluk, lineerite, hassasiyetlerini değerlendirebilecek bilgi birikimini sağlamak.

BAŞA DÖN